有人以為蓮華生大師只是寧瑪派祖師,與格律派毫無關系,其實不然。蓮華生大師是全西藏地區的佛法始祖,這支馬頭明王傳承便是格律派內流行,而又是由蓮華生大師傳下來的。這支傳承,乃蓮華生祖師所傳予一位叫「奔頓究剛巴」的祖師(Dpon Ston Skyur Gang Pa),自此歷代輾轉相傳至今未曾中斷。蓮華生大師傳法予奔頓究剛巴的時候,并非蓮師在人間示現的年代。奔頓究剛巴是一位香巴噶舉派的祖師。他的修行很高,能以「夢身」去不同的地方。這位祖師當時便以這種方式,去到蓮華生大師座前,向他求取一個能令眾生輕易地除障伏魔的法門,蓮師便向他授予了此密相馬頭明王灌頂等,并命他到西藏拉薩附近的一個地方,找一個叫「那祖巴」(Naljorpa)的馬頭明王法門瑜伽士。蓮師早已在那個地方埋下了密相馬頭明王的一種殊勝咒輪,后由剛才說的這位那祖巴取出來。奔頓究剛巴在去到這地方時,果然找到了這個瑜伽士,取得了咒輪和制造咒輪的要訣。自此,這密相馬頭明王修法和制造咒輪的傳承便由奔頓究剛巴傳下來,中間經過宗喀巴大師等,直到衲的恩師。